2 Vẽ cấu trúc phân tử
Bạn đang xem bản rút gọn của tài liệu. Xem và tải ngay bản đầy đủ của tài liệu tại đây (2.24 MB, 47 trang )
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh
Sau khi vẽ xong, nên chọn font và size phù hợp. Nếu các liên kết dài quá, nhìn
không đẹp thì có thể co ngắn bằng cách chọn cụm chữ ở đầu liên kết và di ngắn lại là
được.
Muốn copy sang word hoặc powerpoint ta thực hiện theo các bước sau:
- Click chuột vào một trong hai biểu tượng
phân tử.
trên thanh công cụ để lựa chọn
- Sau khi chọn phân tử cần copy, vào menu Edit chọn lệnh copy hoặc sử dụng tổ
hợp phím Ctrl + C
- Sau đó mở chương trình word hoặc
powerpoint, đặt con trỏ vào vị trí cần dán trên màn
hình soạn thảo, sau đó vào menu Edit chọn lệnh paste
hoặc sử dụng tổ hợp phím Ctrl + V hoặc R-click rồi
chọn paste
Ví dụ 2: Vẽ cấu trúc phân tử theo cách biểu diễn Fischer
- Chọn File/ Open special/ ACS Document 1996
- Chọn công cụ
đưa vào màn hình làm việc kéo thẳng xuống vẽ liên kết thứ nhất và
các liên kết tiếp theo bằng cách đưa trỏ vào cuối nguyên tử kéo thẳng xuống (tổng cộng 5
liên kết)
HVTH: Nguyễn Xuân Qui 26
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh
- Thêm liên kết nằm ngang của nguyên tử thứ hai trong mạch phân tử vừa tạo ra, click lần
nữa để tạo liên kết đôi diện nằm ngang. Lặp lại các bước như ban đầu để vẽ các liên kết
nằm ngang
- Gán thêm các nhóm vào đầu và cuối của chuỗi mạch phân tử
Chọn công cụ
vào CHO
click chọn nguyên tử cacbon ở dòng đầu tiên, text box xuất hiện và gõ
CHO
CH2OH
Click vào nơi nguyên tử cacbon cần nguyên tử hidro, sau đó gõ H
CHO
H
CHO
H
CHO
H
H
H
H
CH2OH
CH2OH
Click vào nguyên tử còn lại, sau đó gõ OH
HVTH: Nguyễn Xuân Qui 27
CHO
H
H
H
CH2OH
H
CH2OH
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh
H
CHO
OH
H
H
HO
H
H
H
CH2OH
CHO
OH
H
H
CH2OH
H
HO
H
CHO
OH
H
OH
H
CH2OH
H
HO
H
HO
CHO
OH
H
OH
H
CH2OH
- Để xem thông tin cấu trúc cơ bản và đưa thong tin vào tài liệu , ta thực hiện các bước
sau:
Click chọn cấu trúc vừa vẽ xong, chọn View/ show Analysis Window, click paste để đưa
thông tin chú thích vào cấu trúc
Ví dụ 3: Vẽ cấu trúc phân tử theo cách biểu diễn Newman
- Click chọn công cụ
vẽ liên kết thứ nhất, thứ hai và thứ ba theo hình sau:
- Thực hiện lệnh copy và paste để có thêm một cấu trúc tương tự, sau đó vẽ thêm một
liên kết nối giữa hai cấu trúc
- Vẽ cấu trúc theo cách biểu diễn Newman
Click công cụ
chọn orbital trống, click vào nguyên tử cần vẽ
HVTH: Nguyễn Xuân Qui 28
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh
Chọn cấu trúc phía sau và xoay 1800
Click chọn cấu trúc phía sau chọn lệnh Object/ Bring to front, click chuột vào khung
chữ nhật dến khi có hình bàn tay sau đó rê vào chỗ cacbon được chọn ở trung tâm orbital
Ví dụ 4: Vẽ phân tử Stiren
HC
Bước 1: Vẽ vòng benzen (như ví dụ 1)
HVTH: Nguyễn Xuân Qui 29
CH2
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh
Bước 2: Vẽ liên kết đơn (như ví dụ 1)
Bước 3: Vẽ nhóm nguyên tử CH-chữ hoa, không dùng chữ thường (như ví dụ 1)
Bước 4: Vẽ liên kết đôi
Click chuột vào biểu tượng liên kết đôi trên thanh công cu
, khi đó chương trình sẽ tự
động báo lỗi hóa trị (nhóm nguyên tử CH được bao quanh bởi một hình vuông màu đỏ).
Đưa con trỏ vào vị trí cần liên kết và vẽ liên kết đôi.
Bước 5: Vẽ nhóm nguyên tử CH2
HVTH: Nguyễn Xuân Qui 30
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh
3.3 Chuyển đổi qua lại giữa tên và cấu trúc
3.3.1 Chuyển đổi từ cấu trúc sang tên
Ví dụ: Chuyển cấu trúc
thành tên
- Vẽ công thức cấu tạo chất trên.
- Chọn phân tử trên.
- Chọn đường dẫn: Structure/ Convert structure to name. Hoặc Nhấn tổ hợp phím tắt:
Alt + Shif t+ Ctrl + N
HVTH: Nguyễn Xuân Qui 31
Sử dụng phần mềm ChemDraw (ChemOffice) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh
Chuyển đổi từ tên sang cấu trúc
Ví dụ: Vẽ cấu trúc DDT
- Chọn đường dẫn: Structure/ Convert Name to Structure. Hoặc Nhấn tổ hợp phím tắt:
Ctrl+ Shif + N.
- Xuất hiện hộp thoại Insert Structure, gõ vào hộp thoại danh pháp IUPAC: 4,4’dichlorodiphenyltrichloroethane rồi chọn OK.
HVTH: Nguyễn Xuân Qui 32
